本作所描述的故事，是独立于《异形大战铁血战士》的原剧情之外的，并且游戏选择了电影式的叙述方式。在游戏中新增了九个最新的单人任务，每一个种族各3个任务。3个不同种族的任务按顺序一一展开，游戏刚开始玩家扮演人类战士，然后作为铁血战士进行三个任务，最后进入异形关卡，只有完成上一个种族的任务后，才可以继续下一种族的任务。九个单人任务连接紧凑，非常注重前因后果，浑然一体。在经过《异形大战铁血战士2：原始猎杀》里惊心动魄的精彩一幕幕后，玩家将亲身体验一个曲折的且令人惊讶的故事。